Comparison of four DNA extraction methods on various tissues and types of Sechium edule ( Jacq.) Sw.;
Comparación de cuatro métodos de extracción de ADN en diferentes tejidos y tipos de Sechium edule (Jacq.) Sw.
Veracruz, México., Gasperin-Sanatta, VS; Facultad de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Universidad Veracruzana. Camino Peñuela-Amatlán de los Reyes s/n. CP 94945. Tel. (55) 2717166129, Fax (55) 2717166410,
Veracruz, México., Alejandre-Rosas, JA; Facultad de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Universidad Veracruzana. Camino Peñuela-Amatlán de los Reyes s/n. CP 94945. Tel. (55) 2717166129, Fax (55) 2717166410,
Veracruz, México., Leyva-Ovalle, OR; Facultad de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Universidad Veracruzana. Camino Peñuela-Amatlán de los Reyes s/n. CP 94945. Tel. (55) 2717166129, Fax (55) 2717166410,
Veracruz, México., Murguía-González, J; Facultad de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Universidad Veracruzana. Camino Peñuela-Amatlán de los Reyes s/n. CP 94945. Tel. (55) 2717166129, Fax (55) 2717166410,
Veracruz, México., Lee-Espinosa, HE; Facultad de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Universidad Veracruzana. Camino Peñuela-Amatlán de los Reyes s/n. CP 94945. Tel. (55) 2717166129, Fax (55) 2717166410,
Veracruz, México., Landero-Torres, I; Facultad de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Universidad Veracruzana. Camino Peñuela-Amatlán de los Reyes s/n. CP 94945. Tel. (55) 2717166129, Fax (55) 2717166410,
Veracruz, México.
Sechium edule is an important crop in Southern Mexico and Central America, and México was the main producer, with 53% of the world production in 2012. This species presents high levels of morphological variation that have resulted in different types of varieties not clearly defined. However, morphological characteristics have not been sufficient to classify S. edule varieties, and it has been difficult to study the species genetic diversity. Because of it, there is a need to develop methods for studying the genetic diversity in S. edule. In this regard, the first step is to find a suitable DNA extraction method. For this reason, in this study four DNA extraction methods (two laboratory protocols, and two commercial kits) were compared for their efficiencies in yield and quality of DNA obtained from four different tissues of four S. edule types. Clear effects of extraction methods, types and tissues of S. edule were observed on DNA yield and quality.
Sechium edule es una planta importante en el sur de México y América Central, y México, con el 53% de la producción en 2012, es el principal productor del mundo. Esta especie presenta altos niveles de variación que han resultado en diferentes tipos o variedades, no claramente definidos. Las características morfológicas no han sido suficientes para clasificar las variedades de S. edule y ha sido difícil el estudio de la diversidad genética de la especie. Debido a esto, existe la necesidad de desarrollar métodos apropiados para el estudio de la diversidad genética del chayote. En este aspecto, el primer paso es contar con un método confiable para extracción de ADN. Por esta razón, en este estudio se comparó la eficiencia de cuatro métodos de extracción de ADN (dos protocolos de laboratorio y dos paquetes comerciales). Se probaron cuatro variedades y cuatro tejidos diferentes de S. edule. Se observaron efectos claros en la cantidad y calidad de ADN extraido, tanto entre los métodos de extracción, como entre los tipos y tejidos de S. edule.
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Veracruz, México.
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